«Коклюшний» кашель поступово змінюється звичайним, який триває ще близько двох тижнів. Так як кашльовий центр роздратований, відновлення характерного кашлю можливе за будь-якої застуди. Це не повернення кашлюку, а реакція організму, що одужав, але не відновився, на новий подразник.
Найчастіше кашлюк викликає ускладненняпов'язані з розвитком вторинної бактеріальної інфекції Коклюш у дорослих проходить досить важко і може стати причиною серйозних ускладнень, таких як судоми та енецфалопатія. У пацієнтів віком від 30 років у 5-9 % випадків виникає пневмонія.
Період спазматичного кашлю триває до 3 тижнів, а потім кашель починає повільно вщухати. До повного одужання може пройти 2-6 місяців, причому кожна застуда, що трапилася в цей період з людиною, що одужує, може супроводжуватися не звичайною кашлем, а типовими коклюшними нападами.
Сприйнятливість людини настільки велика, що й захворів малюк, інші члени сім'ї обов'язково від нього заразяться. Коклюш триває 3 місяці, доки існує кашльовий рефлекс. При цьому приблизно протягом 2 тижнів хвороба практично не має симптомів.