Виконання наказу 66 ознаменував знищення Ордену джедаїв. Перед Галактичним Сенатом Палпатін сказав галактиці, що джедаї були зрадниками, які намагалися вбити його та захопити владу, і знищення джедаїв було зустрінуте Сенатом оплесками.
У фільмі 2005 року «Зоряні війни. Епізод III: Помста ситхів» лиходій Дарт Сідіус каже: «Командер Коді, час настав. Виконати наказ шістдесят шість». Цей порядок змушує солдатів-клонів обернутися проти ворогів Сідіуса, лицарів-джедаїв, і вбити їх, розпочавши те, що відомо як Велика чистка джедаїв.
ЯКЩО не було Наказу 66, і Республіка виграла війну. Ймовірно, Республіка знову зверне військових до сил безпеки. Клони стануть громадянами і матимуть вибір продовжувати служити чи осісти; клони дуже універсальні; вони могли зробити що завгодно.
Але ці скарги часто ігнорують величезну кількість джедаїв, які загинули під час Наказу 66 і незабаром після нього. Ми говоримо, принаймні, кілька тисяч. З огляду на те, як мало вижили — менше 100 станом на 2023 рік — фактичне число загиблих, ймовірно, ближче до дев’яти тисяч або близько того.
Для того, щоб вижити в Наказі 66, потрібна була удача, навички або відсутність у грі. Як джедаї Калеб Дум і Келлеран Бек уникнув Наказу 66 завдяки союзам і уникненню впливу клонів. Падіння Енакіна Скайвокера на темну сторону дозволило йому пережити наказ 66, але спокута прийшла через його сина Люка.
Сітхи виграли б у події. Порядок 66 провалився У цьому прикладі джедаї, швидше за все, не змогли б вижити в Імперії. Зрив Наказу 66 лише відстрочив би неминуче. З майже цілою галактикою на його боці було лише питанням часу, коли Палпатін знищить джедаїв, що залишилися.