Зак вирішує зупинити Генезис, і після перемоги над ним вони з Клаудом прямують до Мідгару, де він сподівається возз’єднатися з Аеріт. Однак Зака і Клауда перехоплює піхота Шінра, і Зак убитий.
Хмара «рятує» Аеріт. Клауд потрапляє у всесвіт, де Аеріт, здається, все ще процвітає, і бореться з Сефіротом разом з нею. У той же час, Зака штовхають у світ, де нічого не залишилося, крім церкви Аеріт, що висить у порожнечі.
Переслідувані Шинрою як єдиним, хто вижив після інциденту в Нібельгеймі, вони були спіймані на околиці Мідгару, з Зак застрелений, останні спогади про Аеріт. Його життя закінчилося, і тоді Клауд став мантією взятися, хоч і мимоволі.
Після Нібельгеймського інциденту його схопили та проводили експерименти протягом чотирьох років. Зак втікає з ув'язнення. Він звільняє свого друга Клауда, який страждає від отруєння мако, і допомагає йому втекти з Нібельхайма.
Хмар знову об’єднується в єдину форму і повертається в свою пам’ять про Нібельгейм. Тіфа слідує за ним повз місто і в реактор мако, щоб спогади про протистояння з Сефіротом. Тіфа поранена, і чорноволосий СОЛДАТ біжить, щоб битися з Сефіротом. Хмара пам'ятає, що СОЛДАТА звуть Зак.
У жодній частині Rebirth немає натяку на те, що Аеріт все ще відчуває почуття до Зака. Вона була повністю закохана в Клауда. Так, це ідеальний кінець, коли Аеріт «виходить заміж» за Зака в потойбіччі, а Клауд і Тіфа — у реальному житті.