Народився у 200 ДБЯ, Чубакка став навігатором гільдії Клаатувак і воював разом з великим магістром-джедаєм Йодою в битві при Кашіїку під час Війн клонів, але був засуджений до рабства Галактичною Імперією.
Сигнал лиха змусив Тарффула та його найдовіреніших воїнів поспішити на допомогу Чубакці проти ненависних трандошанців на мисливських угіддях Васска. пізніше, Тарффул і Чубакка воював пліч-о-пліч із генералом Йодою на полях битви під Кашиїком.
Йода дружить із расою Вукі тому, що під час Війн клонів він воював з ними на Кашиїку разом із Лумінарою Ундулі. Особливо він подружився з якимось Вукі, чиє ім’я я не пам’ятаю, який був надзвичайно близьким до Чубакки.
Чубакка, разом з Тарффулом і майстром-джедаєм Йодою, командував об'єднаними силами вукі та 41-го елітного корпусу клонів Армії Республіки під час битви при Кашіїку в останні дні Війн клонів. Після виконання наказу 66 Чубакка допоміг Йоді втекти від військових-клонів і втекти з Кашиїка.
Але Йода вижив завдяки допомозі тубільців Чубакка і Тарффул, який за допомогою прихованого човника евакуював Майстра-джедая з планети. Згодом хоробрий падаван джедай Гунгі, який пережив бійню джедаїв, був повернутий на те, що залишилося від його рідного світу за допомогою Clone Force 99.
Але Чуї хапає Вейдера. І штовхає його зі скелі. Вейдер використовує силу, щоб виштовхнути лаву на руку Чуві, і сила душить Люка, однак Чуї кинувся схопити Люка. І вдалося втекти від Лорда ситхів.